We are looking for a PhD Candidate to join our Genomics and biotechnology Program and Fruit growing program teams located in Cerdanyola del Vallès and Lleida. We offer the opportunity to be part of an organization with a dynamic, collaborative work environment focused on professional development.

We invite applications from motivated candidates with passion and a strong interest in conducting research and innovation activities on Artificial Intelligence tools for fruit trees phenotyping and seedling performance prediction in breeding programs.

The selected PhD candidate will be involved in a project focused on advancing the digital transformation of the agrifood sector by applying AI-based tools for fruit phenotyping and predictive genomics in pip-fruit breeding (apples and pears). The work will be based primarily at the CRAG research center in Cerdanyola del Vallès, with field activities carried out at IRTA facilities in Lleida. The research aims to develop standardized image-based methods for fruit characterization and apply deep learning models capable of predicting fruit traits from genetic data, thereby improving breeding efficiency and advisory services for growers. Through this interdisciplinary project, the candidate will gain hands-on experience across phenotyping, genomics, bioinformatics, and AI-driven research methods.

Tasks and Responsibilities:

• Collect, curate, and process phenotypic and genotypic datasets, including conducting field experiments, sampling, and phenotyping fruit trees.

• Developing methodologies for image analysis and predictive modelling using Machine learning and AI tools.

• Assis in the design and execution of experiments and in the integration of image-based and genomic datasets.

• Manage research data pipelines, model training workflows, and collaborative tasks across research teams.

• Writing papers for Scientific journals and technical articles.

• Disseminating the Research findings at national and international conferences, workshops, and outreach events.

Required qualifications and experience:

• Candidates must hold one of the following degrees:

  • A Master’s degree in artificial Intelligence, bioinformatics, statistics, computer Science, data management or similar.

  • To be in a position to access a doctoral programme according to the requirements of Catalan universities, i.e. accrediting between 60 and 120 ECTS credits at the official university master's degree level or equivalent.

• Training in statistics, data management and application of AI models.

• Experience in handling large datasets and developing predictive algorithms.

• Knowledge of genomics, biology, and/or plant breeding.

• Experience with programming languagues (e.g. Python or R), bioinformatics tools, or image analysis software.

• Not to have a previous PhD degree.

• Proficiency in English, both written and spoken.

• Valid Class B driving licence, obtained with manual transmission qualification.

• Strong teamwork skills, ability to adapt to multidisciplinary environments and a focus on professional growth and development.

• Strong teamwork skills, ability to adapt to multidisciplinary environments and a focus on professional growth and development.

Desirable requirements:

• Desirable experience in developing web-based tools and software applications to support phenotyping or genomic analyses.

• Additional and/or advanced education in bioinformatics, including practical exposure to genomic data interpretation, pipeline development, or algorithm implementation.

• Field or laboratory experience with crops, preferably in fruit cultivation, agronomy, or plant breeding programs.

• Strong statistical skills and capacity for data processing.

• Excellent written and verbal communication skills.

• Catalan and Spanish are valued.

Advantages of joining our team:

• Supervisor/s: Dr. Maria José Aranzana and Dr. Luís Asín.

• Terms of appointment: 4 years

• Contract: The financial remuneration for the PhD Candidate contract will be €1,363.10/gross per month (19,083.40./gross per annum) and for the first and second years. For this third year, it will be €1,460.46/gross per month (€20,446.44/gross per annum) and for the fourth year it will be €1,825.58/gross per month (€25,558.12/gross per annum) which will be subject to the corresponding withholdings, pursuant to prevailing regulations, and to the collective employment agreement of IRTA. IRTA will also pay the fees of the doctoral school when receiving the enrolment. (1)

• 37.5 hour workweek, with Friday afternoons off

• Intensive work schedule from 15/06 to 15/09

• 22 vacation days

• 3 days of family & work conciliation

• 45 hours of personal days

• Remote work 6 workdays per month

• Flexible Schedule for a good work-life balance.

• Continuous training and professional growth opportunities.

Please know that if you are the chosen candidate and you are from a country which does not belong to the UE, IRTA’s People Department will support you to get the residence and working permits.

Instructions to Apply

If you wish to be considered for this position and believe you meet the requirements, please send your CV and motivation letter.

Equal treatment and equal opportunities are guaranteed for all candidates in the selection process, avoiding stereotypes, bias or barriers linked to gender, sexual orientation, origin, age, ideology, or any other potentially discriminatory condition. The organization also ensures inclusion commitment toward vulnerable groups, and the first round of the selection process is reserved for candidates with functional diversity.

Selection Process:

Curricular assessment: The candidate’s qualifications and merits will be evaluated according to the criteria established in the job offer.

Interview(s): These will be conducted by a Selection Committee to assess the candidate’s suitability in terms of professional experience and competencies.

Additional tests (if applicable): Depending on the position profile and the needs of the process, specific competency-based tests and/or a psychometric test may be included in order to more accurately assess the suitability of the candidates.

Start of contract: before July 2026 (approximately)

(1) The financial remuneration of the PhD Candidate contract may not be less than 56% of the salary established for the category of Research Collaborator F of the Collective Agreement of the IRTA during the first two years, 60% in the third year and 75% in the fourth.

Busquem incorporar un/a estudiant de Doctorat per incorporar-se als equips del Programa de Genòmica i Biotecnologia i del Programa de Fructicultura, ubicats a Cerdanyola del Vallès i Lleida. Oferim l’oportunitat de formar part d’una organització amb un entorn de treball dinàmic i col·laboratiu, orientat al desenvolupament professional.

Convidem a presentar candidatura a persones motivades, amb passió i un fort interès per dur a terme activitats de recerca i innovació en eines d’Intel·ligència Artificial per al fenotipat d’arbres fruiters i la predicció del rendiment de plançons en programes de millora genètica.

La persona seleccionada s’incorporarà a un projecte centrat en avançar en la transformació digital del sector agroalimentari mitjançant l’aplicació d’eines basades en IA per al fenotipat de fruita i la genòmica predictiva en programes de millora de fruiters de llavor (poma i pera). El treball es desenvoluparà principalment al centre de recerca CRAG, a Cerdanyola del Vallès, amb activitats de camp a les instal·lacions de l’IRTA a Lleida. La recerca té com a objectiu desenvolupar mètodes estandarditzats basats en imatges per a la caracterització de la fruita i aplicar models d’aprenentatge profund capaços de predir trets del fruit a partir de dades genètiques, millorant així l’eficiència dels programes de millora i els serveis d’assessorament als productors. Mitjançant aquest projecte interdisciplinari, el/la candidat/a adquirirà experiència pràctica en fenotipat, genòmica, bioinformàtica i metodologies de recerca basades en IA.

Funcions i responsabilitats:

• Recollir, curar i processar conjunts de dades fenotípiques i genotípiques, incloent-hi la realització d’experiments de camp, mostreig i fenotipat d’arbres fruiters.

• Desenvolupar metodologies d’anàlisi d’imatges i modelització predictiva mitjançant eines d’aprenentatge automàtic i IA.

• Assistir en el disseny i l’execució d’experiments i en la integració de conjunts de dades basats en imatges i genòmica.

• Gestionar fluxos de dades de recerca, processos d’entrenament de models i tasques col·laboratives entre equips de recerca.

• Redactar articles per a revistes científiques i publicacions tècniques.

• Difondre els resultats de la recerca en congressos, tallers i activitats de divulgació, tant a nivell nacional com internacional.

Requisits i experiència:

• Màster en Intel·ligència Artificial, bioinformàtica, estadística, informàtica, gestió de dades o similar.

• Complir els requisits d’accés a un programa de doctorat segons la normativa de les universitats catalanes, és a dir, acreditar entre 60 i 120 crèdits ECTS d’un màster universitari oficial o equivalent.

• Formació en estadística, gestió de dades i aplicació de models d’IA.

• Experiència en el tractament de grans conjunts de dades i en el desenvolupament d’algoritmes predictius.

• Coneixements de genòmica, biologia i/o millora vegetal.

• Experiència amb llenguatges de programació (p. ex. Python o R), eines bioinformàtiques o programari d’anàlisi d’imatges.

• No disposar d’un títol de doctorat previ.

• Domini de l’anglès, tant oral com escrit.

• Permís de conduir vigent de classe B, amb habilitació per a transmissió manual.

• Capacitat de treball en equip, adaptació a entorns multidisciplinaris i orientació al desenvolupament professional.

Mèrits addicionals:

• Experiència en el desenvolupament d’eines web i aplicacions de programari per donar suport al fenotipat o a l’anàlisi genòmica.

• Formació addicional i/o avançada en bioinformàtica, amb experiència pràctica en interpretació de dades genòmiques, desenvolupament de pipelines o implementació d’algoritmes.

• Experiència de camp o laboratori amb cultius, preferiblement en fructicultura, agronomia o programes de millora vegetal.

• Sòlids coneixements d’estadística i capacitat de processament de dades.

• Excel·lents habilitats de comunicació oral i escrita.

• Es valoraran coneixements de català i castellà.

Avantatges d'unir-se al nostre equip:

• Direcció de tesi: Dra. Maria José Aranzana i Dr. Luís Asín.

• Durada del contracte: 4 anys.

• Contracte: la retribució bruta serà de 1.363,10 € mensuals (19.083,40 € anuals) el primer i segon any; 1.460,46 € mensuals (20.446,44 € anuals) el tercer any; i 1.825,58 € mensuals (25.558,12 € anuals) el quart any, subjecte a les retencions corresponents segons la normativa vigent i el conveni col·lectiu de l’IRTA. L’IRTA també assumirà el cost de les taxes de l’escola de doctorat en el moment de la matrícula (1).

• Jornada de 37,5 hores setmanals, amb les tardes de divendres lliures.

• Jornada intensiva del 15/06 al 15/09.

• 22 dies de vacances.

• 3 dies de conciliació familiar i laboral.

• 45 hores d’assumptes propis.

• 6 dies de teletreball al mes.

• Horari flexible per afavorir l’equilibri entre vida personal i professional.

• Formació contínua i oportunitats de creixement professional.

Si la persona seleccionada prové d’un país fora de la UE, el Departament de Persones de l’IRTA oferirà suport per a la tramitació dels permisos de residència i treball.

Instruccions per presentar candidatura

Si voleu optar a aquesta plaça i considereu que compliu els requisits, envieu el vostre CV i una carta de motivació.

Es garanteix la igualtat de tracte i d’oportunitats en el procés de selecció, evitant estereotips, biaixos o barreres vinculades al gènere, orientació sexual, origen, edat, ideologia o qualsevol altra condició potencialment discriminatòria. L’organització també garanteix el compromís amb la inclusió de col·lectius vulnerables, i la primera fase del procés de selecció es reserva a persones amb diversitat funcional.

Procés de selecció

• Valoració curricular: s’avaluaran els mèrits i qualificacions segons els criteris establerts a l’oferta.

• Entrevista/es: realitzades per un Comitè de Selecció per valorar l’adequació del perfil en termes d’experiència i competències.

• Proves addicionals (si escau): es podran incloure proves de competències específiques i/o psicomètriques segons el perfil i les necessitats del procés.

Inici del contracte: abans de juliol de 2026 (aproximadament).

(1) La retribució del contracte predoctoral no podrà ser inferior al 56% del salari establert per a la categoria de Col·laborador/a de Recerca F del Conveni Col·lectiu de l’IRTA durant els dos primers anys, al 60% el tercer any i al 75% el quart any.