We are looking for a PhD candidate to join the Animal Health Program team, based in IRTA-CReSA (Bellaterra, Barcelona). We offer the opportunity to be part of an organization with a dynamic, collaborative work environment focused on professional development.

The selected candidate will join the Antimicrobial Stewardship Research Team working in a project funded by the Spanish State Research Agency (AEI) with title "Development of a bacterial-phage consortium and advancing in faecal microbiota transplantation as alternative strategies to antimicrobials to prevent enteric diseases in weaned piglets". The main objective of the project is to develop and validate an innovative bacterial-phage consortium (BacPhag) to modulate the intestinal microbiome and improve piglets' gut health. To achieve this, the project will integrate culturomics, microbial ecology, phage biology, advanced co-culture systems, multicellular porcine intestinal organoid models, and in vivo studies.

Key researchers for the position: Dr. Lourdes Migura-Garcia

Tasks and Responsibilities:

• Perfom classical microbiology techniques, including culture media preparation, isolation of bacteria, minimal inhibitory concentration and in vitro co-culture experiments.

• Development and optimise an anaerobic jejunal organoid model for host-microbiome co-culture experiments.

• Prepare samples and sequencing libraries and contribute to the analysis and interpretation of high-throughput sequencing data.

• Assist in the planning, execution and monitoring of in vivo experiments and conduct farm sampling activities when required.

• Analyse and interpret experimental results and contribute to scientific publications, conference presentations and dissemination activities.

Required qualifications and experience

• Bachelor's degree in Veterinary Medicine and/or Master's degree in Biotechnology, Microbiology or similar with the fulfilment of the academic requirements to access a doctoral program in Spain.

• Previous experience in microbiology and basic knowledge of experimental design and data analysis.

• Knowledge of English.

• Strong teamwork skills, ability to adapt to multidisciplinary environments and a focus on professional growth and development.

• Applicants must not already hold a doctoral degree (PhD)

Desirable requirements

• Experience in molecular techniques such as DNA/RNA extraction, qPCR, sequencing library preparation or flow cytometry.

• Knowledge of high-throughput sequencing technologies and experience in whole-genome, microbiome or transcriptomic data analysis, with basic bioinformatics skills in Linux, R and/or Python.

• Experience in organoids or animal models.

• Languages (Catalan and Spanish).

Advantages of joining our team:

• Contract: 4 years

• Salary:

  • First, second and third year of contract: 23.322,09€ gross per year

  • Fourth year of contract: 26.325,47€ gross per year

*Subject to the corresponding withholdings, pursuant to prevailing regulations, and to the collective employment agreement of IRTA

The doctoral grant provides up to 7.000€ in additional funding to cover:

• Research stays of at least one month at other R&D centres.

• Tuition fees for the four years of the PhD programme.

• 37.5 hour workweek, with Friday afternoons off

• Intensive work schedule from 15/06 to 15/09

• 23 vacation days

• 3 days of family & work conciliation

• 45 hours of personal days

• Remote work 6 workdays per month

• Flexible Schedule for a good work-life balance.

• Continuous training and professional growth opportunities.

Selected candidates must, at the time of signing the employment contract, provide documentation confirming either their admission to a doctoral programme or their enrolment in the programme.

Please know that if you are the chosen candidate and you are from a country which does not belong to the UE, IRTA’s People Department will support you to get the residence and working permits.

Instructions to Apply

If you wish to be considered for this position and believe you meet the requirements, please send your CV and motivation letter.

Equal treatment and equal opportunities are guaranteed for all candidates in the selection process, avoiding stereotypes, bias or barriers linked to gender, sexual orientation, origin, age, ideology, or any other potentially discriminatory condition. The organization also ensures inclusion commitment toward vulnerable groups, and the first round of the selection process is reserved for candidates with functional diversity.

Timings in the Recruitment Process

Curricular assessment: The candidate’s qualifications and merits will be evaluated according to the criteria established in the job offer.

Interview(s): These will be conducted by a Selection Committee to assess the candidate’s suitability in terms of professional experience and competencies.

Additional tests (if applicable): Depending on the position profile and the needs of the process, specific competency-based tests and/or a psychometric test may be included in order to more accurately assess the suitability of the candidates.

Start of contract: January 2027 (approximately)

The contract is part of project PID2025-175031OB-C21, funded by MICIU/AEI/10.13039/501100011033 and by the European Social Fund Plus FSE+.

Estem buscant un/a doctorand/a per incorporar-se a l'equip del Programa de Sanitat Animal, amb seu a l'IRTA-CReSA (Bellaterra, Barcelona). Oferim l'oportunitat de formar part d'una organització amb un entorn de treball dinàmic i col·laboratiu, orientat al desenvolupament professional.

La persona seleccionada s'incorporarà a l'Equip de Recerca en Ús Responsable dels Antimicrobians, que treballa en un projecte finançat per l'Agència Estatal de Recerca (AEI) titulat "Desenvolupament d'un consorci bacteriòfag-bacterià i avanç en el trasplantament de microbiota fecal com a estratègies alternatives als antimicrobians per prevenir les malalties entèriques en garrins deslletats".

L'objectiu principal del projecte és desenvolupar i validar un consorci innovador de bacteris i bacteriòfags (BacPhag) per modular el microbioma intestinal i millorar la salut intestinal dels garrins. Per assolir aquest objectiu, el projecte integrarà tècniques de culturomics, ecologia microbiana, biologia dels bacteriòfags, sistemes avançats de cocultiu, models multicel·lulars d'organoides intestinals porcins i estudis in vivo.

Funcions i responsabilitats:

• Aplicar tècniques clàssiques de microbiologia, incloent-hi la preparació de medis de cultiu, l'aïllament de bacteris, la determinació de la concentració mínima inhibitòria i la realització d'experiments de cocultiu in vitro.

• Desenvolupar i optimitzar un model anaerobi d'organoides jejunals per a experiments de cocultiu entre l'hoste i el microbioma.

• Preparar mostres i biblioteques de seqüenciació, i contribuir a l'anàlisi i la interpretació de dades de seqüenciació d'alt rendiment.

• Donar suport a la planificació, l'execució i el seguiment d'experiments in vivo, així com dur a terme activitats de mostreig en granges quan sigui necessari.

• Analitzar i interpretar els resultats experimentals, i contribuir a l'elaboració de publicacions científiques, presentacions en congressos i activitats de difusió científica.

Requisits i experiència:

• Grau en Veterinària i/o màster en Biotecnologia, Microbiologia o un àmbit afí, amb el compliment dels requisits acadèmics per accedir a un programa de doctorat a Espanya.

• Experiència prèvia en microbiologia i coneixements bàsics de disseny experimental i anàlisi de dades.

• Bon domini de l'anglès.

• Capacitat de treball en equip, adaptabilitat a entorns multidisciplinaris i orientació al creixement i al desenvolupament professional.

• Les persones candidates no poden estar en possessió d'un títol de doctorat (PhD).

Mèrtis addicionals

• Experiència en tècniques de biologia molecular, com ara l'extracció d'ADN/ARN, la qPCR, la preparació de biblioteques de seqüenciació o la citometria de flux.

• Coneixements de tecnologies de seqüenciació d'alt rendiment i experiència en l'anàlisi de dades de genoma complet, microbioma o transcriptòmica, amb coneixements bàsics de bioinformàtica en entorns Linux i dels llenguatges R i/o Python.

• Experiència en l'ús d'organoides o de models animals.

• Coneixement del català i del castellà.

Avantatges d'unir-se al nostre equip:

• Durada del contracte: 4 anys

• Remuneració:

  • Primer, segon i tercer any de contracte: 23.322,09 € bruts anuals.

  • Quart any de contracte: 26.325,47 € bruts anuals.

* Import subjecte a les retencions corresponents, d'acord amb la normativa vigent i el conveni col·lectiu de treball de l'IRTA.

L'ajut predoctoral proporciona fins a 7.000 € addicionals per finançar:

• Estades de recerca d'una durada mínima d'un mes en altres centres d'R+D.

• Les matrícules dels quatre anys del programa de doctorat.

• Jornada de 37,5 hores setmanals, amb tardes de divendres lliures

• Horari intensiu del 15/06 al 15/09

• 23 dies de vacances

• 3 dies de conciliació familiar i laboral

• 45 hores de dies personals

• Treball remot 6 dies al mes

• Horari flexible per un bon equilibri vida personal/laboral

• Formació contínua i oportunitats de desenvolupament professional

Si ets la candidatura escollida i vens d’un país fora de la UE, el Departament de Persones d’IRTA t’assistirà per obtenir els permisos de residència i treball.

Instruccions per presentar candidatura:

Si vols ser considerat/a per a aquesta posició i compleixes els requisits, envia el teu CV i carta de motivació.

Es garanteix igualtat de tracte i oportunitats per a tots els candidats, evitant estereotips, biaixos o barreres per raó de gènere, orientació sexual, origen, edat, ideologia o qualsevol altra condició potencialment discriminatòria. L’organització també garanteix el compromís d’inclusió envers grups vulnerables, i la primera ronda del procés de selecció està reservada a candidats amb diversitat funcional.

Procés de selecció:

• Avaluació curricular: Es valoraran titulacions i mèrits segons els criteris establerts en l’oferta.

• Entrevista(s): Seran realitzades per un Comitè de Selecció per avaluar l’adequació del candidat en experiència i competències professionals.

• Proves addicionals (si escau): Poden incloure proves específiques basades en competències i/o tests psicomètrics segons el perfil de la posició.

Inici de contracte: Gener 2027 (aproximadament)

El contracte forma part del projecte PID2025-175031OB-C21, finançat pel MICIU/AEI/10.13039/501100011033 i pel Fons Social Europeu Plus FSE+.